PerfectDisk to bardzo dobra aplikacja przeznaczona do defragmentowania partycji systemowych działających w oparciu o system plików wspierany przez Windows. Program oferuje takie funkcję jak tryb StealthPatrol wykonywający automatyczną defragmentację tylko wtedy, gdy komputer jest bezczynny czy opcję PerfectDisk's Single File Defrag dającą użytkownikowi możliwość wyboru dowolnych plików do defragmentacji. PerfectDisk został wyposażony także w funkcję automatycznego zwalniania miejsca z takich lokalizacji jak Kosz czy tymczasowe pliki internetowe.

Ta funkcja została także rozbudowana o moduł wyszukiwania duplikatów plików graficznych, tekstowych, muzycznych i filmów. Dodatkowo PerfectDisk można obsługiwać z poziomu wiersza poleceń zarówno dla lokalnych jak i zdalnych operacji. Linia komend jest bardzo rozbudowana i pozwala administratorom na pełną kontrolę nad procesem optymalizacji plików na dyskach twardych.