muCommander to bezpłatny, multiplatformowy menadżer plików oferujący wiele możliwości znanych m.in. z takich aplikacji jak Norton Commander czy Total Commander. Poza takimi podstawowymi opcjami jak kopiowanie, przenoszenie, zmiana nazwy plików, tworzenie i usuwanie katalogów, wysyłanie plików pocztą, muCommander oferuje również funkcję tworzenia i rozpakowywania archiwów plików ZIP (w locie), RAR, TAR, GZip, BZip2, ISO, NRG, Ar, Deb i LST oraz możliwość ograniczania transferu wysyłania czy kopiowania danych.

muCommander obsługuje takie protokoły jak FTP, SFTP, SMB, NFS, HTTP oraz Bonjour.