Free Uninstaller jest zamiennikiem apletu Dodaj/Usuń programy. Program uruchamia się dużo szybciej od systemowego apletu i zawiera szereg dodatkowych funkcji. Głównym zadaniem Free Uninstaller jest usuwanie programów zainstalowanych w systemie Windows oraz usuwanie odinstalowanych i niepotrzebnych już pozostałości we wpisach rejestru systemowego.

Aby odinstalować program, wystarczy tylko zaznaczyć go na liście i kliknąć przycisk Odinstaluj. W dolnej części wyświetlane są najważniejsze informacje dotyczące zaznaczonego programu. Dodatkowo program wyróżnia kolorem czerwonym nieprawidłowe elementy.

Najczęściej są to już usunięte programy, po których pozostały w rejestrze niepotrzebne wpisy. Aby usunąć taki element, należy zaznaczyć go na liście i kliknąć przycisk Usuń.