CloneApp to bezpłatna aplikacja, która pozwala wykonać i przywrócić kopie zapasową ustawień konfiguracyjnych wybranych komponentów Windows oraz popularnych programów działających pod kontrolą tego systemu. Narzędzie po instalacji pozwala na pracę z konfiguracją ponad 200 produktów, w tym między innymi: 7-zip, Adobe Photoshop, AIMP, Alcohol 120%, CCleaner, CDBurnerXP, Dropbox, Free Download Manager, GIMP, Google Chrome, Inno Setup, IrfanView, iTunes, Java, KeePass, Microsoft Office 2010 / 2013 / 2016, Mozilla Firefox, Mozilla Thunderbird, MPC-HC, MyPhoneExplorer, OpenOffice, Pidgin, PuTTy, Skype, Start Menu 8, SumatraPDF, TrueCrypt, uTorrent, VLC media player, Vuze, WinRAR, WinSCP, Wise Disk Cleaner.

Oprócz tego program umożliwia tworzenie/przywracanie konfiguracji np. systemowego pliku hosts, listy szybkiego uruchamiania, elementu "wyślij do", menu Start, paska bocznego i innych. CloneApp uwzględnia konfigurację obsługiwanych aplikacji i elementów Windows przechowywaną zarówno w postaci plików konfiguracyjnych na dysku, jak i w rejestrze.

W kopiach zapasowych utworzonych przez program znajdują się jedynie dane konfiguracyjne.