C'est la suite du jeu des extraterrestres : l'élimination finale. C'est 2768, les extraterrestres semblent avoir été complètement exterminés.

Cependant, d'une certaine façon, ils ont réussi à pénétrer la Terre, directement à la base USM Zéro. Vous vous appelez John et vous êtes l'un des commandos les plus fiables de la société USM. Vous êtes venu à la base par votre vaisseau "Lightning" pour moderniser l'armement.

Malheureusement, à la suite de l'attaque extraterrestre, vous êtes enfermés dans la base et donc forcés de combattre...... Le jeu consiste à éliminer tous les extraterrestres du plateau et à en sortir, tout en essayant de garder le plus de gens possible en vie (les synthétiques ne sont pas inclus). Il dispose de 10 niveaux pour un joueur et de 7 niveaux pour deux joueurs :

6 pour le Deathmatch (tournoi) et 3 pour le mode coopératif. Dans les missions multijoueurs, le deuxième joueur déplace Dexter. Le joueur reçoit 5 types d'armes (fusil, lance-flammes, lance-grenades, lance-grenades, lance-plasma et scie), qui sont utilisées contre les attaquants, parmi lesquelles vous pouvez rencontrer le Faceship, la Reine, un jeune ou un alien adulte.

En plus des modes déjà mentionnés : solo, deathmatch et coopératif, le jeu a aussi d'autres sous-modes. Alien 2 :

Le retour est très dynamique et a un haut niveau de jouabilité.