Master Commander est un gestionnaire de fichiers gratuit (également à usage commercial) qui est une excellente alternative au logiciel Total Commander. L'application, comme dans d'autres programmes de ce type, a un arrangement à deux panneaux d'affichage des fichiers sous la forme d'une liste de fichiers ou d'une arborescence (ainsi que toute combinaison de ceux-ci), supporte les opérations de base sur les fichiers et dossiers (copier, déplacer, supprimer, renommer), a un client FTP intégré, etc. L'application est aussi équipée d'un client FTP intégré.

De plus, l'auteur a enrichi Master Commander avec un support d'archives intégré : ZIP, TAR, GZIP, TGZ, BZIP2, RAR (navigation, compression avec compresseur WinRAR externe), 7ZIP (compression et décompression avec compresseur 7-ZIP) avec la fonction de navigation, copie et visualisation libres des fichiers. Master Commander offre également la possibilité de crypter et décrypter des fichiers en utilisant les algorithmes BASE64, DES, TripleDES, AES (128 et 256 bits) et un certain nombre d'outils incluant la synchronisation de dossiers, le partage et la fusion de fichiers, l'échange de noms multiples, le téléchargement de fichiers du réseau, la conversion de pages de codes et beaucoup plus.

De plus, Master Commander vous permet de placer une signature électronique sous le fichier ainsi que sa vérification ultérieure.